Хотя совместимость с WhatsApp позволила бы Signal и Threema заметно расширить аудиторию, обе компании отказываются развивать это направление. «Мы не собираемся снижать наши высочайшие стандарты конфиденциальности — напротив, мы заинтересованы в их улучшении. Работа с фacebook✴ ✴ Messenger, ........, WhatsApp или даже Matrix привела бы к ухудшению защиты данных», — сказала президент Signal Мередит Уиттакер (Meredith Whittaker).
Согласен с ней и представитель Threema: «Основная проблема в том, что у нас другие стандарты конфиденциальности и безопасности данных. Мы не можем и не станем отступать от них — это основа идеологии Threema».
Несмотря на то, что WhatsApp поддерживает сквозное шифрование по применяемому в Signal и Threema протоколу Signal, у него нет продвинутой защиты метаданных, указывающих, кто, когда и кому отправлял сообщения. Обе компании подчёркивают, что закрытость кода WhatsApp не позволяет установить, как именно обрабатываются данные пользователей.
Помимо этого, заинтересованным в сотрудничестве с WhatsApp компаниям придётся подписать соглашение, по которому они обязуются применять те же стандарты сквозного шифрования, что дополнительно снижает привлекательность подобного сотрудничества.